Các sản phẩm thực phẩm khô thường chứa nhiều bào tử vi khuẩn và nấm.
Có ý kiến cho rằng hoạt độ nước, độ ẩm trong môi trường, nhiệt độ của sản phẩm và nồng độ ozone được sử dụng ảnh hưởng đến hiệu quả của ozone khí đối với các chất gây ô nhiễm vi khuẩn trên thực phẩm khô và các thành phần thực phẩm (Kim và cộng sự, 2003).
Tính chất bề mặt của thực phẩm cũng ảnh hưởng đến khả năng vô hiệu hóa vi sinh vật trong thực phẩm khô bằng ozone.
Cần có nồng độ ozone cao hơn và thời gian xử lý lâu hơn đối với bột ngũ cốc và tiêu xay để đạt được hiệu quả tương đương đối với ngũ cốc nguyên hạt và tiêu xay.
Tương tự, khả năng giải độc aflatoxin cao hơn đạt được ở hạt hồ trăn nguyên hạt so với hồ trăn xay khi xử lý bằng ozone khí.